La grippe moderne est un descendant direct du virus qui a causé la pandémie de 1918.

grippe saisonnière il peut être un descendant direct de la pandémie de 1918 et non le résultat de la combinaison de plusieurs virus, selon de nouvelles recherches.

Tout comme le génome humain au fil des millénaires peut nous donner des informations cruciales sur où, quand et comment notre espèce a évolué, les modifications génomiques d’un virus peuvent nous donner des informations sur la progression des épidémies et des pandémies.

On estime que la pandémie de 1918 a tué entre 50 et 100 millions de personnes dans le monde. Contrairement à notre pandémie actuelle, de nombreuses questions sur la pandémie de 1918 sont restées un mystère en raison des limitations technologiques. En particulier, les virologues ne pouvaient pas être sûrs si la grippe saisonnière H1N1 est un descendant direct de la pandémie de 1918 ou un regroupement au sein d’un sous-type. En d’autres termes, l’une des plus grandes questions que se posent les historiens de la médecine à propos de la pandémie de 1918 est de savoir si la grippe saisonnière moderne est un arrière-petit-fils du virus de la grippe qui a causé la pandémie de 1918, ou un cousin éloigné.

Une nouvelle étude, publiée aujourd’hui dans communication nature, suggère que la grippe saisonnière serait une descendante directe de la grippe de 1918. Cela avait été un mystère car, à l’époque, les scientifiques n’avaient pas encore découvert les virus de la grippe, encore moins avaient la capacité de séquencer le génome d’un virus grippal. Ce n’est qu’à la fin des années 1990 que les chercheurs ont pu utiliser des corps conservés dans le pergélisol pour déterminer que la pandémie de 1918 était en fait le virus de la grippe A du sous-type H1N1.

Le fond – Grâce à une nouvelle technologie, les chercheurs Sébastien Calvignac-Spencer et ses collègues de l’Institut Robert Koch de Berlin, en Allemagne, ont pu déterminer à quel point la grippe saisonnière moderne est liée au virus de 1918 et comment le virus a muté pendant la pandémie de 1918.

Compte Calvignac-Spencer Sens inverse l’intérêt d’utiliser les nouvelles technologies pour comprendre l’évolution virale des pandémies passées.

« Ces types d’outils nous permettent de reconstituer la façon dont les virus sont apparus, se sont propagés et se sont adaptés pendant une pandémie. Identifier les choses qui diffèrent ou sont similaires entre les pandémies nous aidera à mieux nous préparer au prochain événement catastrophique », dit-il.

Ce qu’ils ont fait – Les chercheurs ont séquencé génétiquement des virus prélevés sur 13 échantillons de poumons de personnes décédées de la grippe entre 1901 et 1931. Les poumons avaient été conservés dans des musées à Berlin et à Vienne, en Autriche. Trois des échantillons ont été prélevés sur des personnes décédées en 1918.

Calvignac-Spencer déclare : « Nous nous sommes appuyés sur une stratégie devenue très populaire au cours de la dernière décennie, bien au-delà du domaine des maladies infectieuses, qui consiste à [of] séquencer toutes les molécules d’ARN d’un échantillon donné », explique-t-il, « car les échantillons pathologiques sont généralement fixés dans du formol [a water based-solution of formaldehyde gas], cela se traduit par le blocage d’une partie des molécules d’ARN les liant à d’autres macromolécules. nous modifions [this] En ajoutant une étape où nous faisons littéralement bouillir l’échantillon, cette étape libère une partie de l’ARN verrouillé.

Une infirmière vérifiant un patient dans la salle de la grippe à l’hôpital Walter Reed pendant la pandémie de grippe, Washington DC, vers 1918.Getty

Enfin, les chercheurs ont pu séquencer un génome complet et deux partiels. Ce qui intéressait particulièrement Calvignac-Spencer, c’était que le virus évoluait d’une manière qui pouvait échapper aux défenses du système immunitaire. En d’autres termes, le virus a probablement évolué pour échapper aux défenses immunitaires humaines. Plus précisément, le système immunitaire envoie des interférons pour attaquer un virus auquel il a été exposé en reconnaissant la nucléoprotéine du virus. Calvignac-Spencer et ses collègues ont trouvé deux sites sur la nucléoprotéine qui ont changé entre les première et deuxième vagues de la pandémie. Changer cette nucléoprotéine confondrait le système, rendant la réinfection possible et contribuant à une deuxième vague.

“Bien sûr, nous avons encore très peu de génomes, mais c’est une piste intéressante pour une enquête plus approfondie”, dit-il.

Enfin, les chercheurs ont utilisé une technique appelée “modélisation de l’horloge moléculaire” pour évaluer les changements dans le génome du virus au fil du temps. Selon l’Université d’État de Pennsylvanie, “les biologistes évolutionnistes peuvent utiliser ces informations pour déduire comment les espèces évoluent et identifier la date à laquelle deux espèces ont divergé sur la chronologie de l’évolution”.

Cette méthode a permis aux chercheurs de voir que la souche grippale initiale évoluait d’elle-même chez l’homme, les oiseaux et d’autres mammifères, plutôt que de devenir un virus recombinant dans lequel des parties de génomes de différents virus se combinent pour devenir le sien, comme certains l’avaient fait. postulé la grippe avait.

Au lieu de cela, les chercheurs ont déterminé que ce que nous vivons comme la grippe saisonnière est en fait un descendant direct de ce virus de la grippe de 1918. Heureusement pour nous, c’est une version beaucoup plus faible, et notre système immunitaire a une certaine expérience pour le combattre.

Qu’est-ce que cela peut nous dire sur notre pandémie actuelle de Covid-19 ? — « L’étude des pandémies passées nous permet d’identifier les similitudes et les différences qui nous informent sur ce à quoi peut ressembler une pandémie. Il existe des parallèles et des différences entre la grippe de 1918 et la pandémie actuelle », explique Calvignac-Spencer. « Par exemple, les deux se sont produits par vagues. Cependant, alors que les différentes vagues de la pandémie de covid ont souvent été entraînées par la propagation de nouvelles variantes, nous ne voyons pas un tel remplacement de lignée en 1918.”

L’objectif à long terme est de mieux comprendre les pandémies, dit-il. Au lieu d’utiliser cette pandémie de 1918 pour comprendre la pandémie actuelle, il est plus intéressé à utiliser la pandémie actuelle pour mieux comprendre la pandémie de 1918 et les pandémies en général.

Suivant – Calvignac-Spencer déclare qu’« une limitation majeure de notre travail et de ce type de recherche est vraiment le nombre limité de spécimens/génomes avec lesquels nous pouvons jouer. Imaginez essayer de reconstruire la pandémie de COVID avec 20 génomes, au lieu des > 10 millions que nous avons générés collectivement.

Si nous avions aussi peu de données pour la pandémie actuelle que pour la pandémie de 1918, nous manquerions des variantes et des phases entières de la pandémie. Calvignac-Spencer se préoccupe donc d’élargir autant que possible les données génomiques de la pandémie de 1918.

“Nous travaillons dur pour trouver de nouveaux spécimens pour la pandémie de 1918. C’est très difficile même si le domaine est très collaboratif (de nombreux laboratoires travaillent main dans la main) et que les musées sont très disposés à soutenir cette recherche”, dit-il. «Nous avons également commencé à étendre notre champ d’action aux pandémies de grippe qui ont suivi en 1957-58 et 1968-69. Avec un peu de chance extrême, nous pourrions également trouver des spécimens de pandémies antérieures, comme la désormais célèbre grippe russe de 1889/90, dont l’agent causal peut avoir été la grippe ou l’un des coronavirus humains désormais endémiques (OC43 ).”

En fin de compte, la constitution d’un historique génomique des pandémies passées peut nous aider à mieux anticiper, comprendre et nous préparer aux futures pandémies.

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